O Código de Conduta do inpEV busca a realização dos princípios, valores e missão do instituto e direciona sua postura social face aos diferentes públicos de relacionamento. O documento define preceitos que possam trazer conhecimento, capacidade, experiência e cooperação entre todos os elos da cadeia agrícola integrantes do Sistema.

Assinado por todos os colaboradores do inpEV no momento da admissão, o escopo e abrangência do instrumento inclui orientação a fornecedores, prestadores de serviços, parceiros, empresas e entidades associadas. Prevê que a conduta do instituto depende de cada um, de modo que todos devem ser regidos pelos princípios e valores éticos, de satisfação dos associados e demais stakeholders, responsabilidade socioambiental, segurança, respeito às diferenças, transparência, inovação, espírito de equipe e soluções construídas com o cliente.

O documento aborda temas como ambiente de trabalho, conflito de interesses, preconceitos, relações com órgãos governamentais, responsabilidade de gestores de pessoas e segurança da informação.

Em 2015, à luz das graves denúncias de corrupção envolvendo o poder público e outras organizações, o instituto iniciou um processo de revisão do código de conduta e treinamento dos seus funcionários para a observância de boas práticas e transparência nas relações institucionais com os órgãos públicos.